10x Genomics
シングルセル解析 Chromiumシリーズ
シングルセル解析GEM-X
シングルセル解析 (3’ scRNA-seq)
免疫細胞プロファイリング (5’ scRNA-seq)
シングルセル解析Flex
シングルセルATAC-seq
シングルセルマルチオーム
シングルセルによるATAC-seqで細胞ごとのオープンクロマチンを解析
シングルセルATAC
エピジェネティックな変動から生じる細胞の不均一性を解明
マウス脾臓細胞サンプルからわずか2%の樹状細胞を検出
特徴
- ゲノムワイドにオープンクロマチン領域を検出
- RNA-seqでは分からない転写開始部位や制御領域の情報を解析
- 細胞から抽出した核を用いることでミトコンドリアDNAのコンタミを抑制
- 洗練された解析パイプラインCell Ranger ATAC （無料ダウンロード）
- 使いやすい解析ビューワーLoupe Browser （無料ダウンロード）
試薬キット一覧
| 製品番号 | 製品 | 補足 |
| 【最小キット構成】ATAC-seq v2 4サンプル | ||
| 1000162 | Chromium Next GEM シングルセル H チップキット (16反応) | チップ2枚 |
| 1000406 | Chromium Next GEM シングルセル ATACライブラリー＆ゲルビーズキット v2 (4反応) | チップを含んでいません。 |
| 1000212 | シングルインデックスキット N セット A (96反応) | ATACライブラリー用インデックス |
| 【16サンプル】ATAC-seq v2 16サンプル | ||
| 1000162 | Chromium Next GEM シングルセル H チップキット (16反応) | チップ2枚 |
| 1000390 | Chromium Next GEM シングルセル ATACライブラリー＆ゲルビーズキット v2 (16反応) | チップを含んでいません。 |
| 1000212 | シングルインデックスキット N セット A (96反応) | ATACライブラリー用インデックス |
| （オプション）ATAC-seq v2用核抽出キット | ||
| 1000493 | Chromium Nuclei Isolation キット (16反応) | ATAC-seq用 |
| （オプション）ATAC-seq v2用追加チップキット | ||
| 1000162 | Chromium Next GEM シングルセル H チップキット (16反応) | チップ2枚 |
| 1000161 | Chromium Next GEM シングルセル H チップキット (48反応) | チップ6枚 |